เกี่ยวกับ ThTxGNN
เกี่ยวกับผู้พัฒนา
แพลตฟอร์มนี้พัฒนาและดำเนินการโดย 藥提醒科技有限公司 (yao.care, เลขทะเบียนนิติบุคคล 83620786, 12F, No. 220, Sec. 2, Taiwan Blvd., West Dist., Taichung City, Taiwan)
ThTxGNN คือเว็บไซต์ประจำประเทศไทยของสายผลิตภัณฑ์ "TxGNN Drug Repurposing" ของบริษัท ระบบเดียวกันนี้ถูกนำไปใช้งานใน 30 ประเทศและภูมิภาค โดยแต่ละแห่งใช้ชื่อ {CC}TxGNN (JpTxGNN, UsTxGNN, DETxGNN และอื่นๆ) ที่ {cc}txgnn.yao.care ภาพรวมผลิตภัณฑ์: https://www.yao.care/medical/txgnn/
ตัวโมเดล TxGNN พัฒนาโดย Zitnik Lab แห่ง Harvard Medical School และตีพิมพ์ในวารสาร Nature Medicine แพลตฟอร์มนี้เป็นระบบใช้งานจริงที่ 藥提醒科技有限公司 สร้างขึ้นบนพื้นฐานของโมเดลดังกล่าว ครอบคลุมการบูรณาการข้อมูลการขึ้นทะเบียนยาระดับประเทศ การคาดการณ์แบบคู่ขนานด้วย Knowledge Graph และ Deep Learning การจัดระดับหลักฐานจาก PubMed / ClinicalTrials และการเชื่อมต่อเวชระเบียนอิเล็กทรอนิกส์ด้วย SMART on FHIR
ภาพรวมโครงการ
ThTxGNN (Thailand Therapeutic Graph Neural Network) เป็นระบบคาดการณ์การใช้ยาเก่าในข้อบ่งใช้ใหม่แบบโอเพนซอร์ส ที่ปรับให้เหมาะสมกับบริบทการดูแลสุขภาพของประเทศไทย
วัตถุประสงค์
- ระบุผู้สมัครการใช้ยาเก่าในข้อบ่งใช้ใหม่: ค้นพบการใช้ประโยชน์ทางการรักษาใหม่ที่มีศักยภาพสำหรับยาที่ได้รับอนุมัติในประเทศไทย
- การรวม FHIR: ให้การคาดการณ์ในรูปแบบ HL7 FHIR R4 สำหรับการรวมระบบการดูแลสุขภาพ
- การรวบรวมหลักฐาน: รวบรวมหลักฐานสนับสนุนจากการทดลองทางคลินิกและวรรณกรรม
- บริบทท้องถิ่น: มุ่งเน้นยาในบัญชียาหลักแห่งชาติของประเทศไทย (NLEM)
คุณสมบัติหลัก
การคาดการณ์ด้วย Knowledge Graph
- ใช้ TxGNN Knowledge Graph ที่มี 50,000+ เอนทิตีทางชีวการแพทย์
- แมปยาจาก Thai FDA กับฐานข้อมูลยาสากล
- คาดการณ์ความสัมพันธ์ยา-โรคตามโครงสร้างกราฟ
เป็นไปตามมาตรฐาน FHIR R4
- การคาดการณ์ทั้งหมดพร้อมใช้งานเป็นทรัพยากร FHIR
- ทรัพยากร MedicationKnowledge และ ClinicalUseDefinition
- รองรับ SMART on FHIR สำหรับการรวม EHR
หลักฐานจากหลายแหล่ง
- การค้นหาวรรณกรรม PubMed
- การรวม ClinicalTrials.gov
- Thai Clinical Trial Registry (TCTR)
- ข้อมูลการลงทะเบียน Thai FDA
รองรับภาษาไทย
- การแมปศัพท์โรคภาษาไทย
- การปรับชื่อยาไทยให้เป็นมาตรฐาน
- เอกสารสองภาษา
สแต็คเทคโนโลยี
| ส่วนประกอบ | เทคโนโลยี |
|---|---|
| ภาษา | Python 3.11+ |
| ตัวจัดการแพ็คเกจ | uv |
| เว็บเฟรมเวิร์ก | Jekyll |
| รูปแบบข้อมูล | FHIR R4 JSON |
| โฮสติ้ง | GitHub Pages |
โครงการที่เกี่ยวข้อง
- TxGNN: Knowledge Graph Neural Network ต้นฉบับ (บทความ)
- ThTxGNN: การดำเนินการสำหรับประเทศไทย (reference implementation)
ใบอนุญาต
โครงการนี้เป็นโอเพนซอร์สและพร้อมใช้งานเพื่อวัตถุประสงค์ในการวิจัย
ติดต่อ
- GitHub: ThTxGNN Repository
- ปัญหา: รายงานปัญหาบน GitHub
ข้อจำกัดความรับผิดชอบ
ThTxGNN เป็นเครื่องมือวิจัยและไม่ให้คำแนะนำทางการแพทย์ ผู้สมัครการใช้ยาเก่าในข้อบ่งใช้ใหม่ทั้งหมดที่ระบุผ่านระบบนี้เป็นการคาดการณ์เชิงคอมพิวเตอร์ที่ต้องผ่านการตรวจสอบทางคลินิกอย่างเข้มงวดก่อนนำไปใช้ในการรักษา การตัดสินใจด้านการดูแลสุขภาพควรปรึกษากับผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์ที่มีคุณสมบัติ
กิตติกรรมประกาศ
- ทีมวิจัย TxGNN ที่ Harvard
- Thai FDA สำหรับข้อมูลการลงทะเบียนยา
- DrugBank สำหรับข้อมูลยา
- NCBI สำหรับการเข้าถึง PubMed