วิธีการคาดการณ์
การคาดการณ์ด้วย Knowledge Graph
ThTxGNN ใช้ TxGNN (Therapeutic Target Graph Neural Network) Knowledge Graph เพื่อคาดการณ์ความสัมพันธ์ระหว่างยาและโรคที่มีศักยภาพ
TxGNN Knowledge Graph
TxGNN Knowledge Graph ประกอบด้วย:
- 17,081 โรค ที่แมปกับ DOID (Disease Ontology)
- 7,958 ยา ที่แมปกับ DrugBank
- 80,127 ความสัมพันธ์ยา-โรค รวมถึงข้อบ่งใช้และข้อห้ามใช้
กระบวนการคาดการณ์
- การแมปยา: ยาที่ได้รับอนุมัติจาก Thai FDA แมปกับ DrugBank ID โดยใช้:
- การจับคู่ชื่อสามัญ
- การปรับชื่อทางการค้าให้เป็นมาตรฐาน
- การสกัดสารออกฤทธิ์
- การแมปโรค: ข้อบ่งใช้ภาษาไทยแมปกับชื่อโรคภาษาอังกฤษโดยใช้:
- การแปลโดยตรง
- การค้นหาศัพท์ทางการแพทย์
- ตาราง DISEASE_DICT
- การสืบค้น KG: สำหรับแต่ละยาที่แมปแล้ว สืบค้น Knowledge Graph เพื่อหา:
- ข้อบ่งใช้ที่ทราบ (การอนุมัติที่มีอยู่)
- ข้อบ่งใช้ใหม่ที่มีศักยภาพ (ผู้สมัครการใช้ยาเก่าในข้อบ่งใช้ใหม่)
- การรวบรวมหลักฐาน: สำหรับผู้สมัครที่มีแนวโน้มดี รวบรวมหลักฐานสนับสนุนจาก:
- วรรณกรรม PubMed
- ClinicalTrials.gov
- Thai Clinical Trial Registry (TCTR)
การให้คะแนน
การคาดการณ์รวมคะแนนความเชื่อมั่นตาม:
- โครงสร้างกราฟ (การเชื่อมต่อของโหนด)
- ความแข็งแกร่งของความสัมพันธ์ใน Knowledge Graph
- จำนวนหลักฐานสนับสนุน
ข้อจำกัด
- การคาดการณ์เป็นสมมติฐานเชิงคอมพิวเตอร์ที่ต้องการการตรวจสอบทางคลินิก
- ข้อมูล Knowledge Graph อาจไม่รวมการอนุมัติยาล่าสุด
- สูตรยาเฉพาะในประเทศไทยอาจไม่มีการแมปกับ DrugBank
- การแปลศัพท์โรคอาจสูญเสียความแตกต่างทางคลินิก
ข้อจำกัดความรับผิดชอบ
วิธีการนี้มีไว้เพื่อการวิจัยเท่านั้น ผู้สมัครการใช้ยาเก่าในข้อบ่งใช้ใหม่ที่ระบุผ่านระบบนี้ต้องผ่านการตรวจสอบทางคลินิกอย่างเข้มงวดก่อนนำไปใช้ในการรักษา